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真菌近完成图测序真菌近完成图测序是指对基因组序列未知或无近缘物种基因组信息的某个物种,构建不同插入片段的基因组DNA文库.
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菌群组成谱全长测序研究基于PacBio三代测序平台,能够读取群落微生态系统中微生物的rRNA基因/ITS全长序列,不受制于短序列的局限性,并确保全长序列的测序,从而在种甚至菌株等精细水平,解析菌群多样性和组成谱
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全长转录组测序基于PacBio三代测序平台的全长转录组测序,可直接获取mRNA全长序列,更为准确地解读mRNA结构信息,重点关注基因的可变剪切、融合基因等。
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菌群多样性组成谱测序以细菌 / 古菌 16S rRNA 基因可变区、真菌 18S rRNA 基因可变区或真菌 ITS(Internaltranscribed spacer)内转录间隔区等微生物特征序列(Signature sequence)为靶点,通过检测序列的变异和数量,反映菌群中各类微生物物种的身份和丰度,从而快速...
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质粒& BAC克隆子的全基因组测序,是指基于二代高通量测序技术和/或三代单分子测序技术,对质粒或BAC克隆子的全基因组进行测序、拼接,利用生物信息分析手段,基于测序深度、GC含量以及序列比对结果,挑选质粒或BAC克隆子的全基因组序列。
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线粒体&叶绿体基因组测序,是指采用利用二代/三代测序平台,对动植物线粒体和植物叶绿体进行高通量测序,通过高深度测序和生物信息分析,获得线粒体&叶绿体基因组的序列、编码基因、遗传进化等相关信息。